Webmin não faz cuidado de como suas zonas são organizadas, ligamento do ISC não exige nenhuma ordem específica de registros da zona e não há um erro para coloc tudo na extremidade.
Assim se você está usando o webmin isto será assim. Alternativamente você pode editar os certificados de Webmin que modificam a zona e adiciona seu próprio código que verific comentários e põr novos recorda em lugares apropriados.
Se não - usar a edição manual.
Considerações,
Arty