Infelizmente isso não está soando esperançoso. Ive nunca visto que acontece antes ao apenas reabrir o projeto, mim o sabe pode ocorrer ao promover projetos.
Eu sei que este vem provavelmente como alguma consolação áspera mas para evitar isto que ocorre ou que reduz o custo quando faz mim usar o estúdio visual com usuário de TFS (custo envolvido) ou o estúdio visual com a subversão que utiliza o usuário de VisualSVN (
http://www.visualsvn.com/server/) e cliente do svn de Ankh que integra (
http://ankhsvn.open.collab.net/) ambos não têm nenhum dependente do custo em suas opções que você quer e ambos são maravilhosamente fáceis de setup.
Quando eu fui impertinente e trabalho dentro não verific eu tenho SyncBack configurado para suportar todas minhas áreas de funcionamento (
http://www.2brightsparks.com/freeware/freeware-hub.html)