Eu penso que uma reconstrucção poderia ser uma opção apreciável aqui. Nós não sabemos quais status seu SBS2003 velho é dentro e se pode ser fixo. Mesmo se pode pode tomar-lhe um tempo longo procurar soluções. Às vezes reparar edições é como a colocação do papel de parede sobre as rachaduras - não o resolveu mas cobre-o somente. Assim quando você faz uma outra migração, mais problemas podem aparecer e seu apenas um laço infinito a escavar para soluções. 20 usuários não são demasiado dolorosos ao vir reconstruir de qualquer maneira.
Como eu disse o prêmio SBS2008 vem com uma licença 2008 adicional do usuário - assim, se o orçamento reserva, você pode ir comprar um usuário aceitável e para usar esse recentemente comprado como SBS2008, deixando o SQL no outro usuário.