Você terá que funcionar todos estes comandos no usuário da troca antes da instalação.
http://technet.microsoft.com/en-us/library/bb125224.aspx
A versão do esquema é diferente para a troca 2007 e precisa de ser atualizado à versão do esquema da troca 2010.
Estes comandos estarão funcionados geralmente à revelia quando você funciona o feiticeiro de instalação.