Um programa desonesto no sandboxie nunca conseguirá no contato com o sistema começar com, isso é o ponto de uma caixa de areia. Emula um ambiente completo de Windows para os programas que funcionam para dentro, como uma máquina virtual em uma maneira, com a diferença que este é uma não máquina virtual mas Windows virtual, com um registro falso, um sistema de arquivo falso etc.
Daqui o que material desagradável você tem dentro de sua caixa de areia, afetará somente essa caixa de areia falsificada Windows quando seu sistema permanecer seguro.
Mas se você deseja se certificar que nenhum malware sobrevive a uma sessão, você pode sempre simplesmente suprimir dos índices de sua caixa de areia:
http://www.sandboxie.com/index.php?GettingStartedPartFive
