Плохая идея…
Имейте взгляд здесь:
http://technet.microsoft.com/en-us/library/bb794745.aspxВы можете изменить режим ISA 2006 активно/passive в регистратуре.
Если вы можете сделать только активно FTP, то вы открытый порт 20 к нисколько прибывающий к серверу FTP.