phpmyadmin, остановит на ошибках когда вы импортируете архив, там будет никакими вариантами, котор нужно установить его для того чтобы продолжать обрабатывать предпологает для «игнорирует дубликаты».
Вы можете написать ваш собственный сценарий php к петле читаете архив CSV и вводите показатели в базу данных.
Та дорога, котор вы можете продолжать обрабатывать показатели даже если будут ошибки.