Hola,
Es un valor calculado, yo no lo almacenaría, apenas recalcula según lo necesitado. Usted podría volverlo como campo de su base de datos como
Seleccionar mydate1, mydate2, TIMEDIFF (mydate1, mydate2
) como diff de mytable
esto volverá sus 2 fechas y un timevalue llamado diff
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/date-and-time-functions.html#function_timediff