Você deve testar o HD com a utilidade diagnóstica do fabricante de HD, alguns dele podem fazer alguns reparos básicos, e em seguida esse chkdsk running /r da tentativa outra vez. Se a ferramenta o diz para substituir o HD, bem, que é o que você terá que fazer…
Você encontrará aquelas ferramentas no UBCD:
http://ultimatebootcd.com