A maneira que você faz ele não olha correta a mim enquanto você desdobra sua própria aplicação incompleta enquanto uma lima de .ear e ao mesmo tempo você está fazendo mudanças na aplicação web do defeito desdobrada como ROOT.war. Eu penso que você pode os embalar no .war em seu .ear
Para desmover um .ear você apenas copia uma versão nova sobre ela, ou muda toda a lima nela - esta maneira o .ear será reescrita e desmovida.
Um .war explodido pode ser desdobrado como .war. O Am não sure sobre .ear mas ele é feito provavelmente na mesma maneira - .ear, retendo toda a estrutura de diretório sob ele.
Em uma aplicação explodida é suficiente mudar (“toque”) web.xml para que seja desmovido.