Не будет malware/spyware потому что вы уже заново установили ваш OS. Вы говорите что испытания скорости дают вам хорошие результаты и что YouTube unwatchable. Звучает как ваш ISP будет движением формируя вашу линию. То может случиться по ряду причин - одно из их может быть что вы будете тяжелым потребителем и все время словоизвержений загрузки поэтому они кладут вас в их группу людей где ваше движение ограничено для того чтобы сохранить их ширина полосы частот. Tiscali (ISP Великобритании) делает то все время.
Дайте им звонок и см. они говорят - спросите им если они будут ширина полосы частот движения формируя и дросселируя для некоторых вебсайт