Для вашего сценария, я думаю вы может сделать один setup проект с основным устанавливает и другие проекты установки для средств и большого устанавливают.
Примечание: (1) вы можете добавить экстренный диалог для того чтобы определить тип варианта, но как можете вы остановить потребителя для того чтобы установить большой вариант?
(2) ПРОТИВ установки будет непреклонн в той дороге, потому что не будет доступа к Кодему msi. Инструмент предлагает условно составление будет Installaware только оно дорогие:
http://www.installaware.com
