Hi, вы можете использовать «rsync», в испытательном режиме (--сух-побегите), для того чтобы построить список архивов которые имеют отличая контрольная сумма MD5, или будьте пропавш, между местной и дистанционной директорией. Она будет также recurse в sub-directories, если вы не сказать его в противном случае.
Она инструмент Unix, для которого будут порты Windows, но лично я предпочитает побежать вариант unix, под Cygwin, на Windows.