¿Qué porcentaje de las filas en la tabla usted está suprimiendo?
Puede ser que sea más rápido crear una nueva tabla, insertar las filas que usted quiere guardar, que cae la tabla original después que retitula la nueva tabla.
crear la tabla new_table como (seleccionar * de old_table donde rows_to_keep=1);
caer la tabla old_table;
retitular new_table a old_table;