Quando usate il FQDN significate il hostname pieno della CC che è il termine corretto o voi significate il Domain Name attivo dell'indice (IE. yourdomain.local)?
Se specificate yourdomain.local \ sysvol, andrà a quello primo che risponde a. Non ci sono PDC nei dominii 2003+. Tutta la replica del DCS e può applicare gli aggiornamenti.
Se ci sono lime o le politiche che mancano dalla seconda CC, potete volere fare funzionare NETDIAG e DCDIAG per determinare perché.