IE hat in den Seitenrändern und im Auffüllen errichtet, die nicht bis zu den Standards W3 sind. Sie können ein unterschiedliches stylesheet verursachen, das nur IE für alle mögliche divs/Kästen sehen kann, die richtig nicht in IE ausgerichtet sind. Es gibt einen großen Artikel hier:
http://www.456bereastreet.com/archive/200612/internet_explorer_and_the_css_box_model/